Выявление генов резистентности к гликопептидным и бета-лактамным антибиотикам в соскобе из урогенитального тракта в Альметьевске

Подготовка к исследованию

Женщинам рекомендуется сдавать анализ до менструации или через 2 дня после ее окончания и не ранее чем через 2 часа после мочеиспускания. Накануне и в день обследования женщинам не рекомендуется выполнять спринцевание влагалища, а в день исследования не проводить туалет половых органов. За 3-5 дней до предполагаемого исследования необходимо исключить применение жиросодержащих вагинальных препаратов (свечи, кремы, вагинальные таблетки). Не рекомендуется взятие биоматериала на фоне проведения антибактериальной терапии (общей/местной) и во время менструации, ранее 24-48 часов после полового контакта, интравагинального УЗИ и кольпоскопии. Мужчинам взятие соскоба следует проводить не ранее 2 часов после мочеиспускания до приема антибактериальных и прововирусных препаратов. Исключить за 24-48 часов даже защищенный половой контакт.

Описание

В последние десятилетия в России, как и во всем мире, отмечается стремительное распространение устойчивости возбудителей инфекционных заболеваний к антибактериальным препаратам. Развитие лекарственной резистентности приводит к появлению способности микроорганизмов сохранять свою жизнедеятельность, несмотря на применение этиотропной терапии. Локус исследования: Соскоб с урогенитального тракта.
Существуют несколько основных механизмов собственной устойчивости бактерий к антибиотикам: ферментативная инактивация, уменьшение проницаемости внешних структур микробной клетки, модификация внутриклеточной мишени, активное выведение лекарства, активация метаболического шунта.
Резистентность микроорганизмов может быть природной и приобретённой, но формирование её во всех случаях обусловлено генетически. Появление и распространение приобретенной резистентности составляет основную клиническую проблему, поскольку ее наличие у конкретной бактерии – возбудителя инфекционной болезни - невозможно прогнозировать. Гены, ассоциированные с этой способностью, зачастую локализованы на мобильных генетических элементах, что способствует их быстрому распространению между бактериями. Интенсификации этого процесса способствуют избыточное и необоснованное назначение антибактериальных препаратов; самолечение, сопровождающееся недостаточностью знаний об этиологии инфекционного процесса, спектре действия антибиотиков; использование АБП для лечения и стимуляции роста животных и птиц в сельском хозяйстве.
В последнее время активно появляются сообщения об устойчивости некоторых штаммов бактерий более чем к трем классам АБП (так называемая мультирезистентность или полирезистентность); ко всем АБП, кроме одного-двух классов (экстремальная резистентность); ко всем АБП (панрезистентность).
Бета-лактамные антибиотики относятся к активно применяемым препаратам. По химическому строению они разделяются на несколько групп: пенициллины, цефалоспорины, карбапенемы и монобактамы, общим компонентом которых является наличие бета-лактамного кольца. Бактериальные ферменты, способные расщеплять эти антибиотики и содержащие в своей структуре циклическую амидную связь, носят названия бета-лактамаз. К настоящему времени описано более 850 различных бета-лактамаз и их количество растет с каждым годом. На основе их важнейших свойств: субстратная специфичность к пенициллинам, цефалоспоринам, монобактамам, карбапенемам; хромосомная или плазмидная локализация; чувствительность к ингибиторам созданы различные системы классификации ферментов.
К бета-лактамазам широкого спектра относятся ферменты А2 (TEM, SHV), вырабатываемые представителями семейства Enterobacteriaceae и способные инактивировать пенициллины и цефалоспорины I-II поколения. Бета-лактамазы класса А2 расширенного спектра действия (БЛРС или ESBL) обеспечивают резистентность почти ко всем пенициллинам и цефалоспоринам I-IV поколения, а также часто обладают ассоциированной резистентностью к антибиотикам других классов. К этим ферментам относятся TEM, SHV, CTX.
Встречаются ферменты, способные инактивировать карбапенемы и другие беталактамные антибиотики. Эти карбапенемазы относятся к сериновым бета-лактамазам: молекулярный класс А (GES, KPC) и D (группы OXA-23-like, OXA-40-like, OXA-48-like, OXA-51-like и др.) или к металло-бета-лактамазам: класс В (IMP, VIM).
Бета-лактамазы-OXA, имеющие незначительные отличия в строении, объединяются в группы ферментов. Например, OXA-23-like – это группа ферментов, состоящая из 19 ферментов, подобных OXA-23.
Грамположительные микроорганизмы, устойчивые к АБП, также остаются этиологически значимыми, например, представители рода Staphylococcus. Наиболее патогенным среди них является вид S. aureus. Наличие метициллин-резистентности характеризует штаммы как MRS и MRSA.
Препаратами выбора при инфекциях, вызванных MRSA\MRS, энтерококками и другими грамположительными бактериями в настоящее время являются гликопептиды. Известны несколько типов ванкомицин-резистентности (VanA, VanB и др.). Важную клиническую значимость имеют VRSA и VRE.
Таким образом, устойчивость к АБП характеризуется высокой скоростью распространения, различается по группам бактерий, по группам лекарственных препаратов и варьируется по географическим областям.
Молекулярно-генетические методы позволяют выявлять гены, ассоциированные с резистентностью к АБП. Преимуществами такого подхода являются: высокая чувствительность скорость получения результатов, стандартизованность и технологичность исследования. Важно, что при проведении исследования не требуются манипуляции с живыми бактериальными культурами, а это, в свою очередь, служит предотвращению распространения и циркуляции микроорганизмов внутри лечебно-диагностических и лабораторных учреждений.
Результаты исследования для выявления генов резистентности к гликопептидным и бета - лактамным антибиотикам у бактерий методом ПЦР в режиме реального времени персонализированы, дают развернутую картину этиологии резистентности к гликопептидным и бета-лактамным антибиотикам, позволяют сократить сроки для выбора оптимальной антибактериальной терапии и снизить экономические затраты на лечение.

Показания к назначению

• Исследовании вспышек острых и хронических инфекций, связанных с оказанием
медицинской помощи;
• Верификации результатов фенотипических методов внутривидового типирования
(антибиотикорезистентности), направленного на выявление госпитальных штаммов;
• При слежении за циркуляцией международных эпидемических клонов в пределах
территориальных единиц, субъектов РФ и на национальном уровне.

Интерферирующие факторы

—

Причины отклонения показателей от нормы (повышенные значения)

Обнаружен(-ы) ген(-ы) резистентности к бета-лактамным антибиотикам.

Причины отклонения показателей от нормы (сниженные значения)

Не обнаружены гены резистентности к гликопептидным и бета-лактамным антибиотикам.

Метод:

ПЦР с детекцией в режиме реального времени;

Анализатор:

Детектирующий амплификатор ДТ-Прайм, ДНК-Технология, Россия;

Аналитическая чувствительность тест-системы:

83,16–100%

Аналитическая специфичность тест-системы:

83,16–100%